Temporada 1

El líder del equipo IMF, Dan Briggs, reúne a su equipo por primera vez. La misión: recuperar dos ojivas nucleares pertenecientes al General Río Domínguez de una caja fuerte en un hotel de Santa Costa.

El equipo del IMF debe desacreditar a Janos Karq, conocido como “el Carnicero de los Balcanes”, haciendo que su jefe de seguridad capture a un agente, Sparrow, quien luego incriminará a Karq.

Imry Rogosh es un asesino en masa que mata para provocar disturbios políticos. Su próximo objetivo es Los Ángeles, así que el IMF lo deja inconsciente simulando un accidente automovilístico. Cuando Rogosh "despierta", se encuentra en una celda de prisión en su propio país, tres años en el futuro.

El equipo del IMF se infiltra como parte de un circo para rescatar al Cardenal Anton Vossek, quien está prisionero en la impenetrable cárcel de Seravno. Vossek es el líder del movimiento de liberación del país, en rebelión contra el coronel Scutari, y está a la espera de un juicio falso antes de su ejecución.

Rollin logra evitar a los guardias y escapar, pero Vossek es trasladado a una nueva celda en confinamiento solitario. Briggs idea un nuevo plan y consigue comunicárselo al encarcelado Rollin.

El Príncipe Iben Kostas planea usar su dinero para financiar una guerra. Infiltrándose en su casino, el equipo del IMF entra en acción.

En el país de Valeria, el equipo del IMF debe asegurarse de que la máquina de votación manipulada por el corrupto partido Nacionalista no les otorgue la victoria en las elecciones.

El mafioso Frank Egan secuestra a la hija de un amigo de Dan y la usa como rehén para obligar a Dan y al equipo a liberar a un testigo clave en su contra, Augie Gorman.

Rollin y Cinnamon trabajan solos para recuperar un carrete de alambre de grabación que contiene información sobre un proyecto de guerra química dirigido contra Estados Unidos. El mensajero que lo transportaba fue asesinado por el enemigo y el alambre desapareció.

El agente enemigo Janos Passik se está preparando para entrenar a 200 agentes extranjeros con el objetivo de infiltrarse en Estados Unidos y llevar a cabo algún tipo de guerra bacteriológica. El equipo descubre que Passik ha creado una réplica de un “típico pueblo estadounidense” para entrenar a sus agentes y enseñarles a integrarse en la sociedad norteamericana.

La esposa de un científico fallecido, Kurt Zubrovnik, está siendo presionada por fuerzas del Este para que trabaje para ellos. Están utilizando a un falso psíquico para convencer a la esposa de que su difunto marido quiere desertar. Acompañados por la "consultora psíquica" del IMF.

Anastas Poltroni es el jefe de un sindicato internacional de narcóticos y se ha refugiado en un país sin tratado de extradición. El equipo del IMF recibe la misión de atraerlo sin secuestrarlo (para evitar la publicidad).

La agente doble Elena Del Barra está actuando de manera extraña, enviando un microfilm con secretos de defensa de su propio país. Rollin es enviado a investigar y a devolver el microfilm sin que se detecte su robo.

Un desertor ha sido objetivo de dos grupos rivales del mismo país extranjero. El equipo debe desacreditar al grupo más joven para que Estados Unidos pueda manejar más fácilmente al grupo tradicional. El IMF organiza que el asesino del grupo más joven, Fetyukov, deba seducir a Cinnamon para acercarse al desertor.

El IMF debe apoderarse de una gran cantidad de oro nazi a través de cuatro jóvenes, hijos de los principales asistentes de Hitler, que son enviados a Suiza para reunirse por primera vez y juntar sus partes del "rompecabezas". Uno de los hombres, el único conocido por ellos, es reemplazado por Rollin. Cada uno tiene una parte de un número de cuenta, y el equipo necesita hipnotizar y engañar al gerente del banco para que les entregue el número completo de la cuenta y luego transmitírselo a Rollin.

El Dr. Cherlotov, un científico de un poder enemigo, no logró desertar al Occidente cuando lo hizo su esposa. Ahora que ha desarrollado un sistema antibalístico barato y efectivo, el IMF recibe la orden de sacarlo. Desafortunadamente, descubren que Cherlotov no quiere desertar.

El gánster Jack Wellman está llevando el crimen organizado a la política, matando a ciertos políticos y reemplazándolos con hombres más simpatizantes del sindicato. El equipo se infiltra como camareros.

Josef Varsh planea juzgar a un estadounidense con cargos falsos, desacreditar a Occidente y ganar poder. Rollin, disfrazado de Dan, se encuentra con una mujer que traicionó a su novio/espía occidental.

Henrik Durvard ha tomado el control del país de Lombounda mediante un golpe militar y mantiene a los nativos bajo terror. Ha obtenido un diamante de los mineros nativos, y el IMF recibe la misión de arrebatárselo.

Un miembro encarcelado del partido nazi, Herbert Raynor, es liberado de prisión y está siendo transportado (junto con su hija) a Puerto Huberra en Sudamérica, junto con otros nazis. Todos ellos están siendo llevados allí por un benefactor desconocido.

Un ex guardia de prisión, Sefra, ha conseguido una provisión de cesio 138, el cual explota a temperaturas superiores a los 70 grados. Sefra planea vender la muestra y la fórmula desde la base de prisión cerrada donde trabajó en el pasado.

Andreas Solowiechek, un miembro de una delegación comercial comunista, es arrestado tras asesinar a un senador de EE. UU., Townsend. El patrocinador de Townsend, McMillan, está reuniendo a sus seguidores para que EE. UU. rompa todas las negociaciones comerciales con los rusos. Se cree que Solowiechek no actuaba bajo órdenes de su gobierno, por lo que el equipo del IMF debe lograr que confiese.

Miklos Klaar, un cineasta del Telón de Acero, tiene una película de soldados estadounidenses y planea editarla en una película de atrocidades para desacreditar a EE. UU. Ha recreado la jungla como un set a partir de la única copia del film que posee.

El Primer Ministro Larya de Svardia está trabajando para establecer la democracia, pero desconoce que su protegido personal, el Viceprimer Ministro Pavel, planea instaurar una dictadura. El equipo debe convencer a Larya de los planes de Pavel. El IMF simula un viaje en tren para Larya.

El operativo enemigo Kiri ha secuestrado al enviado de EE. UU. Carl Wilson y tiene a un impostor, Gort, que lo está suplantando para desacreditar un acuerdo comercial con EE. UU. El equipo debe rescatar a Wilson y frustrar la suplantación antes de que Kiri mate a Wilson.

Vincent Deane es un músico de jazz y agente encubierto de inteligencia de EE. UU. que ha memorizado los planes de un microcircuito, pero fue capturado y encarcelado. El IMF debe sacarlo de allí.

Un oficial de inteligencia estadounidense, Hughes, ha desertado al enemigo con la única copia de un mensaje clasificado ultrasecreto. El IMF debe llegar hasta él, sacarlo, desacreditarlo y recuperar el mensaje antes de que el enemigo pueda conseguir a un criptógrafo.

Un promotor de inversiones, Alex Lowell, tomó control de un fabricante de hardware de defensa ultrasecreto de la OTAN y se escapó a Sudamérica para venderlos a potencias enemigas. El IMF necesita recuperar los documentos de acciones por un valor de 80 millones de dólares.