Temporada 2

Después de salir del parque acuático, la familia se queda atascada en un embotellamiento. Francis apuesta a sus compañeros en la escuela que se puede comer 100 Cuaks. Dewey regresa a casa.

Francis va a visitar la casa para poder tener con los muchachos un día de brujas posterior al día festivo, para eso construirán una catapulta. Mientras que Hal está muy incomodo por un conductor imprudente, donde construye un tope. Sin embargo, lo destruye. Hal le enseña una lección, robando y mandando al fondo de un lago el automóvil.

Lois les da dinero a los muchachos para que le compren un regalo de cumpleaños. Sin embargo, ellos se lo gastan comprándose golosinas y a Lois solo le compran una revista de bicicletas, esto hace que se decepcione y se vaya de la casa.

los Kenarbans invitan a Malcolm y su familia a cenar en un restaurante, donde ya en el lugar Stevie juega con Reese un juego muy pesado, Abe se va con Hal al bar a tomar y Kitty se queda con Lois donde ella le enseña a no reprimir su furia. Al final Stevie se venga de Reese, Abe queda completamente ebrio y Kitty por primera vez saca su furia reprimida.

La familia pasa unas vacaciones en un casino, Hal, Malcolm y Reese van vagando en un rango de artillería del ejército después de haber sido expulsados del cómputo de las tarjetas en un juego de casino.

Mientas Hal y Lois van a una convención, una niñera sexy va a cuidar a los muchachos.

Hal encuentra un ropero tirado y piensa que es el regalo perfecto para Lois pero cuando lo abre salen cientos de murciélagos, mientras, Lois y Craig son atentados de un robo en Lucky Aide, donde Craig confiesa su amor por Lois.

Para perderse el baile, Malcolm hace que le den terapia. Lois y Hal descubren que tienen segundo baño, sin embargo, lo esconden. Francis se encarga de lavar ropa en la militarizada.

Malcolm recibe un papel en una obra de teatro de la escuela y está obsesionado con los chismes.

Después de haber sido golpeado por una niña en una pelea de lucha grecoromana, Reese abandona su imagen de la intimidación, provocando que los niños que le tenían mucho temor empiezen aprovecharse de la situación para poder vengarse de Malcolm por hacer comentarios burlones hacia ellos. Mientras tanto, Francis trata de evitar su cumpleaños en la academia porque los cadetes afeitan "todo" el vello corporal a la persona que celebra su cumpleaños 17.

Después de romperle por accidente el brazo a una anciana, Malcolm debe ayudarla en sus labores cotidianas. Richie, el amigo de Francis, es enviado a la militarizada, donde se gana la amistad del comandante.

Malcolm conoce a la nueva niña Cynthia, que comienza a tener un flechazo con él.

La familia se da cuenta que tienen nuevos vecinos con los cuales se llevan bien, pero al darse cuenta de como son en realidad se convierten en sus enemigos, excepto por Hal que es el único que se lleva bien con el otro jefe de la familia.

Hal termina en crisis por mención de un niño de la clase de Dewey, así que deja el trabajo y se pone a pintar. Francis se ve obligado a trabajar en Lucky Aide.

Los padres de Lois visitan la casa. Víctor habla con Reese, en tanto que Ida molesta a Malcolm. Hal compra un refrigerador nuevo, que es destruido en un incidente con una granada de mano. Hal amenaza a los padres de Lois, pidiéndoles dinero.

Lois es infraccionada por interrumpir el paso a un vehículo por un policía corrupto, Craig le muestra un video a Malcolm y resultaba que Lois se había equivocado, luego este muestra el video a Hal y después se lo enseñan a Lois, después admite de que se había equivocado al final que no era verdad ya que desde otra toma se ve que Lois tenia razón. Después, Hal destruye la evidencia y Lois no se entera.

Malcolm es enviado al hospital por razones equívocas mientras que el resto de la familia juega risk. Francis y los cadetes van a una huelga de hambre porque Spangler se llevó su televisión.

Reese es enviado a una clase de cocina por un castigo, luego resulta que tiene talento y le gusta cocinar, pero lo sacan de la clase por hacer trampa para ganar un concurso.

Lois obliga a Malcolm a que le dé clases a Reese para que suba sus calificaciones. Los esfuerzos llegan ser positivos, sin embargo, el maestro de Reese quien está en contra de él trata de sabotear sus esfuerzos para poder enviarlo a una clase de lento aprendizaje y Malcolm quien ya sabe las intenciones del maestro, tratará de resolver un examen en lugar de Reese para que él pase con una buena calificación. Como historia secundaria, Francis se pelea con su madre y se va a vivir con Richie.

El episodio se divide en 2 partes. En éstas, se ven las perspectivas de los personajes, si uno de ellos se los hubiera llevado al boliche. Las dos partes terminan con finales parecidos.

Malcolm y Reese pelean para ver quién irá con Francis a ver la lucha libre, sin embargo, Francis no se lleva a nadie. Dewey está a cargo del gato de Craig, pero se le escapa. Hal lo atrae con comida, pero termina atrayendo a otros gatos. Por deshacerse de todos, accidentalmente Lois quema el apartamento de Craig intentando que el gato vuelva, por lo cual se ven obligados a que Craig y su gato vivan con ellos.

Craig vive en casa de la familia, donde descubren el modo de vida de Craig. Mientras, los chicos encuentran y reparan una minimoto, en la que Reese se lesiona.

Malcolm, Reese y Stevie planean ir a la feria del condado porque ya son los ultimos días que estará en la ciudad, pero Dewey los escucha y no tienen de otra más que llevarlo. Para ir, engañan a Lois y Hal diciendoles que irán a la casa de Stevie y él hace lo mismo con sus papás diciendo que dormirá en la casa de Malcolm, sin embargo, ya en la feria los muchachos quedan atrapados, pero también huyen de un malvado oficial de policía.

Hal y Dewey dejan un sofá en las vías férreas, y la ciudad termina siendo evacuada después de que un tren que contenía desechos tóxicos chocara contra el sofá. Reese intenta hacer mercado negro con los demás. Dewey finge perder a sus padres, para ganar dinero. Tras algunas peleas con su madre (incluyendo el peor bochorno vergonzoso público con un niño), Malcolm logra dormir en un catre.

Lois cree que está embarazada y se lo dice a Hal provocando que tengan una discusión, mientras se muestran "flashbacks" de los nacimientos de Francis, Reese, Malcolm y Dewey.