Temporada 2

Comienza el segundo año en la academia y ya que Dana se fue a Francia por un programa de intercambio, a Zoey y Nicole se les asigna una nueva compañera, Lola Martínez, quien resulta ser toda una rara. Mientras, Logan lleva a la habitación un sistema completo de entretenimiento que molesta a Chase y Michael.

En la clase del Sr. Bender, él decide hacer una cápsula del tiempo para que los estudiantes pongan algo que los represente.

Para las elecciones de presidente estudiantil, Chase nomina a Zoey y viceversa.

Logan está a cargo de hacer una casa embrujada para los estudiantes de la escuela menor, prometiendo no sólo asustar a los niños, sino también hacerlos gritar. Mientras, Michael es perseguido por unos turistas franceses que piensan que está herido.

Dustin comienza a salir con Trisha Kirby (Jennette McCurdy), a quien Zoey no le agrada ya que es una chica muy mala y, tras su promesa de no meterse en la vida de Dustin, le pide a Chase que evite que ellos sigan saliendo.

Chase y Michael hacen un programa, en el cual Zoey y Logan, al discutir fuertemente de ciertos asuntos, comienzan su propio segmento llamado "Él Dice, Ella Dice", el cual a pesar de ser un éxito, provoca que todos los chicos y chicas de la academia discutan fuertemente.

Luego de una discusión con los chicos, las chicas no pueden relajarse en el techo de ellos, por lo que deciden probarles que ellos pueden comportarse como chicos aunque haya chicas cerca.

Zoey desafía a unos machistas nerds a una lucha de robots, pero para poder construir un robot, le piden ayuda a Quinn. Sin embargo, ella se niega a seguir ayudándoles cuando Logan se burla de ella. Luego de ello, le piden ayuda a Miles, el chico más inteligente de la PCA, quien acepta con la condición de que Nicole salga con él.

Luego de ayudarla a estudiar para biología, Lola se enamora de Chase y quiere salir con él, quien cancela todos los planes que tenía con Zoey, quien por esto se pone claramente celosa. Mientras, Dustin le pide ayuda a Logan para conquistar a las chicas, pero en realidad le enseña a ser como él.

Los chicos van a la casa de playa de Logan para el receso de primavera, donde descubren que van a ser probados para un programa nuevo del padre de Logan sobre batalla de sexos. En esto, tras recibir unos Tekmates, Chase le envía por accidente un mensaje a Zoey diciendo que la ama.

Chase decide tomar el Tekmate de Zoey para tratar de borrar el mensaje, pero sin éxito. Luego de ello, obtienen la batalla de sexos la cual es grabada por cámaras escondidas. Al final Zoey y Chase platicaban sobre el mensaje que le envió a Zoey por accidente que decía que la ama pero Chase se quedaba callado sin decir nada para que ella no se enojara con él.

El Sushi Rox, el restaurante de sushi de la academia, es consumido por las llamas, por lo cual Zoey y la banda hacen una subasta de personas para reunir dinero para reconstruirlo.

Luego de llamar a su familia, la alpaca de Quinn, Otis, la extraña mucho, lo cual hace que Quinn se vuelva nostálgica y se deprima.